The abundancia y riqueza de hongos micorrizógenos arbusculares (HMA), así como la micorriza arbuscular (MA) en las raíces de cuatro especies de helechos (Cheilanthes myriophylla, Ch. bonariensis, Blechnum appendiculatum y Adiantum capillus-veneris) se evaluaron en relación con la fertilidad del suelo durante febrero y diciembre. Los helechos se evaluaron en dos ecosistemas de Oaxaca, México: Ch. myriophylla y Ch. bonariensis en el matorral xerófilo semiárido, y B. appendiculatum y A. capillus-veneris en el bosque mesófilo de montaña. El suelo rizosférico de las cuatro especies tuvo mayor abundancia y riqueza de esporas de HMA que el suelo sin helechos. En total se registraron 13 géneros y 32 morfoespecies de HMA. Las morfoespecies de Glomus se detectaron en ambos ecosistemas, mientras que Racocetra, Scutellospora, Diversispora y Gigaspora fueron exclusivas del bosque mesófilo. La baja micorrización arbuscular se atribuyó a los altos niveles de materia orgánica, N total y P inorgánico; la MA fue más activa en Ch. bonariensis, especie del matorral xerófilo, lo cual sugiere que la MA es regulada por la disponibilidad de recursos y la identidad del helecho. Las cuatro especies forman reservorios de HMA, lo que indica que los helechos podrían generar inóculos nativos útiles para la restauración ambiental de sus ecosistemas.