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Protocolos de extracción de ARN total a partir del tejido embrionario de nuez pecanera (Carya illinoinensis [Wangenh.] K. Koch)
ISSN: 2007-4018
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Palabras clave

nogal pecanero
ácido ribonucleico
bromuro de cetiltrimetilamonio
polifenoles
PCR de transcripción inversa

Cómo citar

Rodríguez-González, M., Arreola-Ávila, J. G., Ávila-Rodríguez, V., García-González, F., Quezada-Rivera, J. J., Mota-Ituarte, M. del S., & Borja-de la Rosa, A. (2022). Protocolos de extracción de ARN total a partir del tejido embrionario de nuez pecanera (Carya illinoinensis [Wangenh.] K. Koch). Revista Chapingo Serie Ciencias Forestales Y Del Ambiente, 29(1), 131–145. https://doi.org/10.5154/r.rchscfa.2022.08.057

Resumen

Introducción: Los estudios de expresión génica requieren protocolos de extracción que permitan la obtención de ARN de alta calidad, especialmente cuando se trabaja con tejidos ricos en polisacáridos, lípidos y polifenoles como el tejido embrionario de nuez pecanera (Carya illinoinensis [Wangenh.] K. Koch).
Objetivo: Evaluar la eficiencia de ocho métodos de extracción de ARN total a partir de tejido embrionario de nuez pecanera.
Materiales y métodos: Se evaluaron ocho protocolos de extracción de ARN total basados en el reactivo TRI Reagent®, buffer CTAB (bromuro de hexadeciltrimetilamonio) y un kit comercial. El rendimiento y calidad de ARN total se determinaron por espectrofotometría (UV/visible). La viabilidad e integridad del ARN se analizó mediante RT-PCR utilizando actina como gen de referencia.
Resultados y discusión: Los protocolos de extracción basados en el reactivo TRI Reagent® permitieron la obtención de concentraciones altas de ARN total, pero con grado elevado de contaminación. Mediante el uso del kit comercial fue posible la extracción de ARN total, pero sin la pureza óptima esperada. Finalmente, los protocolos basados en el buffer CTAB consiguieron rendimientos de ARN total de calidad óptima.
Conclusiones: La calidad del ARN total varía de acuerdo con la eficiencia del método utilizado. El protocolo CTAB 4 representa una alternativa eficaz para el aislamiento de ARN de tejidos embrionarios de C. illinoinensis.

Ideas destacas

  • La presencia de polifenoles y polisacáridos dificultan la extracción de ARN total de nuez pecanera.
  • Se evaluaron protocolos de extracción de ARN basados en TRI Reagent®, buffer CTAB y un kit comercial.
  • La calidad del ARN total varió de acuerdo con la eficiencia del método utilizado.
  • El reactivo TRI Reagent® permitió concentraciones altas de ARN total, pero contaminado.
  • El buffer CTAB garantizó la obtención y calidad de ARN total del tejido embrionario de nuez pecanera.
https://doi.org/10.5154/r.rchscfa.2022.08.057
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Citas

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